为了杜绝兵将不知的弊端，兵部分作两个部门，一个是后勤部门，一个是训练部门，，全天下的部队后勤都归兵部后勤司管理。队伍的后勤官员不归本支队伍主官管辖。
而天下士兵的训练全部统一，不再各行其是。
兵部尚书不再由文官担当，必须以武将为本。
罢免毛文龙原先一切职务，包括东江镇总兵官，以大明辽王任兵部尚书，掌管天下一切兵马。
明确规定，为了监督他主导的国策不在出现反复，毛文龙的兵部尚书职务为终身制，以后其他任何人不得执行。
也就是说，毛文龙就是看着大家，好好的贯彻这些政策制度，谁敢捣蛋，毛文龙有权灭了他。
至于他要捣蛋，谁灭了他，这个没说。
而又一道圣旨明确的规定了毛文龙和他的军队的责任：为了维护新政的稳定，原东江镇撤销，原复辽军已经完成了他的使命而撤销。
将大明划分十个军区，派驻原复辽军分别组扎。
卢象升，朝鲜总督。辖区朝鲜。
刘兴贤，东北总督。辖区辽东外原蒙东，到白令海峡，到北——之极地。
毛承勇，蒙古总督。辖区中蒙西蒙。
毛承禄，西北总督。辖区青海西藏西域。
毛仲明。山陕四川总督。
洪承畴，西南总督，辖区江浙江西福建云贵。
张盘，中原总督，辖区河南河北安徽山东。
张盘。直隶总督。
刘兴基。辽东总督。
张之及。京师戍卫。
毛学礼，大明水师总提督。
郑宏达，天津府尹，马维忠，内阁次辅兼任顺天府尹。
范文杰，南京府尹。
这些人因功而升，但也明确但告诉天下，毛文龙推行的新政，就在毛文龙集团但掌控之下，谁有意见，谁反对，请你站出来走两步。
而广大的中原外收复的和扩展的地区，则设立十个大区，由朝廷派兵驻守，一旦出现叛乱，则兵部可调动全国之兵出征剿灭。
在强势的毛文龙推动下，五十万大军虎视眈眈的看管下，大明的政府架构完善过度之。
天下形势焕然一新，全天下的百姓看到大明真正的中兴，并为屹立世界而大步前进。
毛文龙在八十高龄的时候，在经过二十年的看守之后，大明再也不会反复，才辞去所有职务，开始专心致志的带着一把小锄头，到各地掩埋瓷器去了，最终在一次掩埋的时候，不小心闪了老腰，从此一病不起，在留下一句：“我完成了我的使命，我改变了大汉民族的命运。”的自夸样式的遗言后撒手人寰。
随着他的离世，按照他的当初的规划，将全天下的毛家军，改名护国军，他的爱将儿子们全部退出历史舞台，泯灭了毛文龙在大明的一切痕迹。